Ubiquitin (Ub) ist allgegenwärtig. Dieses kleine, 76-Rückstands-Protein wird verwendet, um zelluläre Proteine für den Abbau durch das Ubiquitin-Proteasom-System (UPS) zu markieren.Ub-Ligasen und Deubiquitylierungsenzyme (DUB)Wie Sie sich vorstellen können, ist dieser dynamische Prozess wichtig.und Dysregulation kann zu einer Reihe schlechter Dinge führenDaher wäre das Verständnis der Beziehungen zwischen der DUB- oder Ub-Ligase-Aktivität und spezifischen Krankheiten hilfreich bei der Entwicklung von Inhibitoren oder anderen therapeutischen Interventionen.Eine Reihe von Ub-basierten Proben zur Aktivitätsbasierten Protein-Profiling (ABPP) wurden entwickelt., in der Regel mit einem Affinitätskennzeichen wie Hämagglutinin (HA) oder Biotin am N-Ende und einem elektrophilen Sprengkopf am C-Ende, wie Propargylamid (PA), Vinylmethylester (VME),oder Dehydroalanin (Dha)Viele dieser Proben beschränken sich jedoch auf Versuche mit gereinigten rekombinanten Proteinen oder Zelllysaten aufgrund der schlechten Zellpenetration.Sonden müssen wirklich in der Lage sein, Zellen zu betreten und mit Enzymen intrazellulär zu reagieren, um die nützlichsten Informationen für die Drogenzielung und andere Bemühungen zu erhalten.

• Ubiquitinketten unterschiedlicher Länge und Arten können auf biochemische Funktionen wie Interaktion und Enzymaktivität sowie auf die Strukturbiologie von Kristallen angewendet werden.Elektronenmikroskope und Kernmagnetresonanz.
• Ubiquitin-abgeleitete Cross-Linking-Sonden können verwendet werden, um unbekannte, interagierende Proteine aus normalen oder erkrankten Zellen und neue Ziele zur Behandlung von Krankheiten zu erkennen.
• Ubiquitin-abgeleitete Fluoreszenzproben können zur Analyse der Aktivität und Spezifität von Deubiquitinase und zum Hochleistungs-Screening von Deubiquitinase-Hemmern verwendet werden.